41 research outputs found

    Phenotypic, serotypic and genetic characterization and antimicrobial susceptibility determination of vibrio anguillarum, isolated from cultured sea bass (dicentrarchus labrax l., 1758) in the southeast Black Sea, Turkey

    Get PDF
    WOS: 000386746100068In this study, identification of Vibrio isolates from infected sea bass (Dicentrarchus labrax L., 1758) in the Black Sea was performed by using conventional methods, and API 20E test kits. All isolates were confirmed by PCR assays specific to the 16S rRNA gene of bacterium. Lam agglutination test was carried out on all vibrio isolates by using raised rabbit serum against Vibrio anguillarum 01. According to the result of agglutination, biochemical and PCR tests isolated bacteria determined as V. anguillarum. API 20E profile for V. anguillarum isolates was usually determined as 3207526. the sequenced Vibrio isolates were found to be similar to V. anguillarum strain at the rate of 98-100% in GenBank under different accession numbers. in addition, in the treatment for vibriosis, it was intended to detect the most effective agents. Results of the testing susceptibility to antibiotics showed that V. anguillarum isolates were resistant to 100% ampicillin, 63.6% erythromycin, 59.1% sulfamethoxazole, 54.6% streptomycin, 45.5% sulfamethoxazole-trimethoprim, and 40.9% oxytetracycline, but all strains except two V. anguillarum were found susceptible to 9.1% other antibiotics (oxolinic acid, enrofloxacin and florfenicol). According to the results of the susceptibility test, florfenicol and enrofloxacin were suggested as the most effective chemotherapeutics for vibriosis treatment.Recep Tayyip Erdogan University Research Project FundRecep Tayyip Erdogan University [2015.103.02.1]This study was funded by the Recep Tayyip Erdogan University Research Project Fund (Project No. 2015.103.02.1

    Determination of antibacterial effect of tannic acid against some bacterial pathogens isolated from fish

    Get PDF
    Bu çalışmada, bitkilerden doğal ekstraksiyon işlemiyle elde edilen ve su ürünleri yetiştiriciliğinde tatlandırıcı yem katkı maddesi olarak kullanılan Silvafeed TSP’nin (tannik asit) Aeromonas hydrophila, Pseudomonas fluorescens, Yersinia ruckeri, Vibrio anguillarum ve Escherichia coli’ye (ATCC 25922) karşı antimikrobiyal etkinliği agar well difüzyon ve minimal inhibisyon konsantrasyon testi (MİK) ile araştırıldı. Agar well difüzyon testinde, A. hydrophila, E. coli ve Y. ruckeri izolatlarının 12,5 µg/ml'nin üzerindeki konsantrasyonlara duyarlı iken, P. fluorescens ve V. anguillarum izolatlarının 6,25 µg/ml'nin üzerindeki tannik asit konsantrasyonlarına hassas olduğu belirlendi. Disk difuzyon testinde P. fluorescens’in gentamisin ve doksisiklin hariç çalışmada kullanılan diğer antimikrobiyel ajanlara karşı dirençli olduğu, A. hydrophila, E. coli, V. anguillarum ve Y. ruckeri’nin ise ampisilin hariç çalışmada kullanılan diğer antibiyotiklere karşı hassas olduğu tespit edildi. Bu çalışmada, P. fluorescens izolatının florfenikol (FFC)’ün 200 µg/ml hariç bütün konsantrasyonları ve E. coli izolatının sadece FFC’nin 3,125 µg/ml konsantrasyonuna dirençli olduğu tespit eddildi. Fakat, doksisiklinin beş bakteri izolatına karşı duyarlı olduğu belirlendi. Tannik asitin 6,25 µg/ml konsantrasyonuna P. fluorescens ve V. anguillarum dirençli iken, 12.5 µg/ml konsantrasyonu ise E. coli, A. hydrophila ve Y. ruckeri'nin dirençli olduğu belirlendi. Tannik asitin MİK değeri; E. coli için 187,5 µg/ml, A. hydrophila için 250 µg/ml, P. fluorescens için 31,25 µg/ml, V. anguillarum 375 µg/ml ve Y. ruckeri için 125 µg/ml olarak belirlendi. P. fluorescens izolatı için florfenikolün MİK değerleri belirlenemezken; E. coli, A. hydrophila, V. anguillarum ve Y. ruckeri için sırasıyla, 25 µg/ml, 12,5 µg/ml, 12,5 µg/ml ve 50 µg/ml olduğu belirlendi.In this study, the antimicrobial activity was investigated Silvafeed TSP (tannic acid) obtained by natural extraction from plants and used as a flavoring feed additive in aquaculture, against Aeromonas hydrophila, Pseudomonas fluorescens, Yersinia ruckeri, Vibrio anguillarum and Escherichia coli (ATCC 25922). For this purpose, agar well diffusion and minimal inhibition concentration (MIC) tests were used. In the agar well diffusion test, it was determined that A. hydrophila, E. coli and Y. ruckeri isolates were sensitive to concentrations above 12,5 µg/ml, while P. fluorescens and V. anguillarum isolates were sensitive to tannic acid concentrations above 6,25 µg/ml. In the disc diffusion test, it was determined that P. fluorescens was resistant to other antimicrobial agents used in the study except gentamicin and doxycycline, and A. hydrophila, E. coli, V. anguillarum and Y. ruckeri were sensitive to other antibiotics used in the study except ampicillin. In this study, it was determined that the P. fluorescens isolate was resistant to all concentrations of florfenicol (FFC) except 200 µg/ml and the E. coli isolate was resistant only to the 3.125 µg/ml concentration of FFC. However, doxycycline concentrations were determined to be sensitive to five bacterial isolates. It was determined that P. fluorescens and V. anguillarum were resistant to the 6.25 µg/ml concentration, while E. coli, A. hydrophila and Y. ruckeri were resistant to the 12.5 µg/ml concentration of tannic acid. The MIC values of tannic acid for E. coli, A. hydrophila, P. fluorescens, V. anguillarum and Y. ruckeri were determined as 187,5 µg/ml, 250 µg/ml, 31.25 µg/ml, 375 µg/ml and 125 µg/ml, respectively. While MIC values of florfenicol could not be determined for P. fluorescens isolate; It was determined as 25 µg/ml, 12.5 µg/ml, 12.5 µg/ml and 50 µg/ml for E. coli, A. hydrophila, P. fluorescens, V. anguillarum and Y. ruckeri, respectively

    Lactococcus garvieae infection and treatment observed in Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss)

    Get PDF
    Bu çalışma, 2012 Ocak ve 2017 Eylül tarihleri arasında Doğu Karadeniz Bölgesi’ndeki 12 farklı Gökkuşağı alabalık çiftliklerinden balık örnekleri toplandı. Bu örneklerden toplam 100 adet bakteri izole edildi. Tüm izolatların tanımlanması geleneksel biyokimyasal testler, API 20 strep testi ve PZR testi kullanılarak yapıldı. Pozitif kontrol olarak ATCC 43921 referans izolatı kullanıldı. API 20 strep test sonuçlarına göre izole edilen 100 bakteri izolatından 65 izolatın Lactococcus garvieae olduğu belirlendi. Bu izolatları moleküler olarak L. garvieae izolatına özel pLG-1 ve pLG-2 (16S rRNA) referans genleri kullanılarak PCR testi ile doğrulandı. Çalışmanın sonucunda, Gökkuşağı alabalıklarından izole edilen 100 izolattan 65’inin L. garvieae olduğu teyit edildi. Antibiyogram test sonuçlarına göre izolatların sulfamethoksazol, streptomisin ve sulfametoksazol+trimetoprim’e %100, ampisiline %94,2, oksitetrasiklin %72,5, eritromisine %55,07 ve oksolinik asit %43,5 oranında dirençli olduğu tespit edildi. Ek olarak enrofloksasin %26,09, doksisikline %20,3, amoksiklin ve florfenikole %8,7 oranında daha düşük seviyede direnç tespit edildi. Hastalığın tedavisinde, balık üreticisine antibiyogram test sonuçlarına göre en etkili olan florfenikol, amoksiklin ve doksisiklin antibiyotiklerden birinin kullanılması önerildiIn this study, fish samples were collected from 12 different Rainbow trout farms in the Eastern Black Sea Region between January 2012 and September 2017. A total of 100 bacteria were isolated from these samples. Identification of all isolates were carried out by using conventional biochemical tests, API 20 strep tests and PCR tests. ATCC 43921 reference isolate was used as a positive control. According to API 20 strep test results, 65 isolates from 100 bacterial isolates were determined to be Lactococcus garvieae. These isolates were molecularly confirmed by PCR testing using the pLG-1 and pLG-2 (16S rRNA) reference genes specific to L. garvieae isolate. It was confirmed by PCR testing using the reference genes pLG-1 and pLG-2 (16S rRNA) specific to the L. garvieae isolate. As a result of this study, 65 isolates out of 100 bacterial isolates isolated from diseased rainbow trout were confirmed to be L. garvieae. According to the antibiogram test results, the isolates were 100% resistant to sulfamethoxazole, streptomycin and sulfamethoxazole+trimethoprim, 94.2% to ampicillin, 72.5% to oxytetracycline, 55.07% to erythromycin and 43.5% to oxolinic acid. In addition, lower levels of resistance were detected with enrofloxacin 26.09%, doxycycline 20.3%, amoxicillin and florfenicol 8.7%. In the treatment of the disease, the fish producer was advised to use one of the most effective antibiotics, florfenicol, amoxicillin and doxycycline, according to the antibiogram test result

    Determination of usage doses of some chemical substances in the prevention of fungal ınfections in rainbow trout eggs

    Get PDF
    Bu çalışmada, döllenmiş gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss) yumurtalarında görülen mantar etkenlerine karşı koruyucu tedbirlerin alınması amaçlanmıştır. Döllenmiş yumurtalarda mantar oluşumunu önlemek için farklı dozlardaki formaldehit (0,5, 1 ve 2 ml/L), iyot (0,5, 1 ve 2 ml/L), hidrojen peroksit (5, 10 ve 15 ml/L), elma sirke (1, 5 ve 10 ml/L) ve kaya tuzu (5, 10 ve 15 gr/L) 10'ar dakika süreyle günde bir kez kullanılmıştır. Bu kimyasal maddelerin farklı konsantrasyonlarındaki deneme sonuçları karşılaştırıldığında en iyi yaşama oranının 2 ml/L dozunda iyot uygulanan grupta olduğu tespit edilmiştir. Çalışma sonunda I. denemenin kontrol grubundaki yumurtaların tamamının mantarlaşmaya bağlı olarak öldüğü tespit edilmiştir. Gökkuşağı alabalığı kuluçkahanelerinde sürdürülebilir bir üretim için döllenmiş yumurtaların ilk günden itibaren günde en az bir kez 2 ml/L dozunda polivinil pirolidon-iyot ile 10 dakika süreyle dezenfekte edilmesi gerektiği belirlenmiştir.In this study, it was aimed to take protective measures against fungal agents in fertilized rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) eggs. To prevent fungal growth in fertilized eggs, different doses of formaldehyde (0.5, 1 and 2 ml/L), iodine (0.5, 1 and 2 ml/L), hydrogen peroxide (5, 10 and 15 ml/L), apple vinegar (1, 5 and 10 ml/L) and rock salt (5, 10 and 15 g/L) were used once a day for 10 minutes. When the trial results of these chemicals at different concentrations were compared, it was determined that the best survival rate was in the group that was administered iodine at a dose of 2 ml/L. At the end of the study, it was determined that all of the eggs in the control group of the first trial died due to fungus. It has been determined that for a sustainable production in rainbow trout hatcheries, fertilized eggs should be disinfected at least once a day for 10 minutes with a dose of 2 ml/L polyvinyl pyrrolidone-iodine from the first day

    Occurrence of gas bubble disease in a rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) farm

    Get PDF
    Rize ilinde gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss) çiftliğinde porsiyon büyüklüğünde (250 gr) balıkta gaz kabarcığı hastalığı vakası tespit edildi. Çiftliğe gelen suyun, yükseklik ve mesafe farkı olan bir dereden kapalı bir boru içinde geldiği belirlendi. Ayrıca, suyun boruyu tamamen doldurmadığı, suyun borunun içine hava çektiği ve aşırı doygun hale geldiği gözlemlendi. Suyun dinlendirilmeden (gazı uçurulmadan) direkt balık havuzlarına akıtıldığı belirlendi. Balık havuzlarında serbest oksijen (O2) miktarı, oksijen doygunluğu, su sıcaklığı sırasıyla 10.03-11.88 mg/L, %116.9-139.1 ve 20.3-20.9ºC olarak ölçüldü. Sudaki gaz doygunluğunu %103'in altına düşürmek için farklı yöntemler uygulandı; boru ağzı küçültüldü, dinlendirme havuzu yapılarak su havuza direkt verilmesi engellendi ve balık yetiştirme havuzlarına suyun fıskiye şeklinde akıtılmak gibi. Suyun gaz doygunluğu %100’e düşürüldüğünde gaz kabarcığı belirtilerinin ortadan kalktığı görüldü. Bu vakada porsiyonluk boydaki gökkuşağı alabalıklarında ölüm oranının %5 olduğu tespit edildi. Sonuç olarak, bu uygulamalar ile çiftlikteki gaz kabarcığı sorunu çözüldü.: A case of gas bubble disease was found in portion size (250 g) fish in a rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) farm in Rize province. It was determined that the water coming to the farm came in a closed pipe from a stream at a distance of altitude and distance difference. In addition, it was observed that the water did not completely fill the pipe, the water drew air into the pipe and became supersaturated. It was determined that the water was poured directly into the fish ponds without resting (without degassing). The amount of free oxygen (O2), oxygen saturation and water temperature in the fish ponds were measured as 10.03-11.88 mg/L, 116.9- 139.1% and 20.3-20.9ºC, respectively. Different methods were applied to reduce the gas saturation in water below 103%; the pipe mouth was made smaller, a resting pool was built to prevent the direct supply of water to the pool, and the water is poured into the fish breeding pools in the form of a fountain. In this case, it was determined that the mortality rate in portion size rainbow trout was 5%. As a result, with these applications, the gas bubble problem in the farm was solved

    The Hidden Though Flourishing Justification of Intellectual Property Laws: Distributive Justice, National Versus International Approaches

    Get PDF
    Bu çalışmada, Gökkuşağı alabalıklarında enfeksiyonoluşturan Ichthyophthirius multifiliis’infarklı bölgelerden izole edilmiş saha suşlarının genotipik yapıları temelindeimmundominant özellik gösteren rekombinant immobilizan antijenlerini(i-antijen) kodlayan genlerin bakteriyel ekspresyon sistemine klonlanarakeksprese ve karakterize edilmeleri, antijenik profillerinin ortaya çıkarılmasıve aşı adayı olabilecek rekombinant antijenlerin elde edilmesi amaçlanmıştır.&nbsp;Çalışmada 2018 ve 2019 yıllarının Temmuz ve Ağustos ayları arasında Gökkuşağıalabalığı yetiştiriciliğinin yoğun yapıldığı Samsun, Rize, Kayseri, Elazığ,Burdur, Antalya ve Muğla illerinde bulunan işletmeler ziyaret edilerek balıkpopülasyonları üzerinde saha araştırmaları yürütülmüş ve I. multifiliis ile enfekte bulunan balıklardan ilgili protokolleregöre izolasyon gerçekleştirilmiştir. Laboratuvara uygun solüsyonlar ve soğukzincir altında intikal ettirilen örneklerden cDNA ve gDNA izolasyonlarıgerçekleştirilmiştir. I. multifiliis i-antijengen lokusunun amplifikasyonu amacıyla optimum primer dizaynı için ön çalışmalaryürütülmüş ve hedef gen bölgeleri uygun amplifikasyon koşullarında PCR’daçoğaltılmıştır. Elde edilen amplikonlar agaroz jel üzerinden saflaştırılmıştır.Multiple gen lokusu sekanslarının belirlenebilmesi amacıyla ilgili pürifiyeamplikonlar pJET 1.2 plazmit vektörüne CloneJET PCR cloning kit (Thermo FisherScientific) kullanılarak klonlanmış ve katı besi yerinde belirlenenkolonilerden rekombinant plazmid DNA izolasyonları gerçekleştirilmiştir. Rekombinantplazmidler spesifik primerlerle çift yönlü olarak sekanslanmış vekromotogramlar De Novo Assemble üzerinden işlenerek hedef insert sekanslarvektör plazmid DNA’sı içerisinden çıkarılmış ve konsensüs sekanslar eldeedilmiştir. İlgili primerlerin i-antijen gen lokusu içerisinde çoğalttığı fragmentlerinbelirlenebilmesi amacıyla PCR ürünleri ayrıca yeni nesil dizileme teknolojisi (NGS)kullanılarak işlenmiş ve elde edilen dizilimlerin gen veri tabanlarındakimevcut tüm i-antijen gen lokusları ile filogenetik ilişkileri araştırılmıştır.Tüm bu araştırmalar sonucu karakterize edilen i-antijen genlerinin ekspreseettiği proteinlerin rekombinant olarak eldesi için çalışmalargerçekleştirilmiştir. Aşı adayı potansiyeli olabilecek bazı lokusların bakteriyelekspresyon sistemine aktarımı için kodon optimizasyonları yapılarak pET-32a(+)ekspresyon plazmid DNA’sına (Novagen) klonlanması gerçekleştirilmiştir. Eldeedilen rekombinant plazmitler E. colikompotent BL21(DE3) hücrelerine transforme edilerek optimum koşullardaekspresyon çalışmaları yürütülmüş ve ekspresyon etkinliği SDS-PAGE ve WesternBlot analizleri ile belirlenmiştir. Eksprese edilen rekombinant i-antijenproteinleri afinite kromotografi kulanılarak saflaştırılmış ve immunreaktiflikleri Western Blot analizleri ile tespit edilmiştir.&nbsp;Çalışmada,Elazığ, Rize ve Muğla illerinde ziyaret edilen işletmelerdeki Gökkuşağıalabalıklarında deri ve solungaçlarından hazırlanan preparatların mikroskobikincelemeleri ile I. multifiliisenfeksiyonunun yaygın olduğu görülmüştür. İlgili bölgelerden elde edilen I. multifiliis suşlarına ait cDNA vegDNA izolatlarının i-antijen gen lokusunun dizayn edilen pirmerlerle PCR’daamplifiye edilmesi sonucu 1200-1300 bp büyüklüğünde amplikonlar saptanmıştır.Pürifiye amplikonların klonlanması sonucu ilgili izolatlara ait açık okumaçerçevesi (ORF) sekanslarının analizinde birbirleriyle %38,3-58,8 arasındafarklılık gösteren 4 farklı i-antijen izoformu tespit edilmiştir. Bu izoformlararasında bir antijenik lokusun (ImulTR1-iant) her üç ildeki alabalıkpopülasyonlarından izole edilen I.multifiliis suşlarında da var olduğu NGS analizlerinde görülmüştür.ImulTR1-iant ORF sekansı ayrıca Amerika Birleşik Devletleri’nde alabalıklardanizole edilmiş bir i-antijen izoformuyla %83,3 identiklik gösterirken, diğertespit edilen izoformlara ait sekansların GenBank veri tabanında mevcuti-antijen sekanslarından oldukça farklı olduğu belirlenmiştir. Araştırmadarekaombinant i-antijen eldesi için yaygın belirlenen ImulTR1-iant izolatıüzerinden analizler yürütülmüştür. Bu izoformu kodlayan gen bölgesinin 1263bpbüyüklüğünde olduğu ve ORF’nin 420 amino asitten teşekkül ettiğibelirlenmiştir. ORF amino asit sekanslarının in-slico analizlerde 42,552 kDabüyüklüğünde bir proteini eksprese ettiği, bu proteinin sitoplazmik olduğu vetransmembran bölge içermediği tespit edilmiştir. Ayrıca ilgili ORF sekansıiçerisinde uzunluğu 7-22aa arasında değişen 21 antijenik bölge olduğubelirlenmiştir. Kodon optimizasyonu yapılmış olan ImulTR1-iant izoformuna ait pET-32a(+)rekombinant plazmitinin E. colikompotent BL21(DE3) hücrelerine transformasyonu ve ekspresyonu sonrasındayapılan SDS-PAGE analizlerinde in-silico analiz sonuçlarına paralel olarakyaklaşık 43kDa’luk protein jel üzerinde görüntülenmiştir. İlgili rekombinantprotein afinite kromotografide HisTrap FF crude (GE Healthcare) kolonlarıkullanılarak saflaştırılmış ve pürifiye rekombinant antijenin immun-reaktifliğiWestern-Blot analizleriyle gösterilmiştir.&nbsp;ErciyesÜniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından TOA-2017-7742 kodnumarasıyla desteklenen bu çalışma ile Türkiye’de gökkuşağı alabalıklarındasorun oluşturan ve ekonomik kayıplara yol açan I. multifiliis suşlarına karşı biyoteknolojik aşı geliştirilmesinoktasında aşı adayı olabilecek immobilizan antijenler üzerine özgün veriler sağlanmıştır.Elde edilen aşı adayı rekombinant antijenlerin etkinliğini ortaya koymanoktasında laboratuvar ve saha şartlarında immunizasyon ve çelınç enfeksiyondenemeleri için yeni proje çalışmaları planlanmaktadır.</style

    Cadmium toxicity affects chlorophyll a and b content, antioxidant enzyme activities and mineral nutrient accumulation in strawberry

    Get PDF
    BACKGROUND: Cadmium (Cd) is well known as one of the most toxic metals affecting the environment and can severely restrict plant growth and development. In this study, Cd toxicities were studied in strawberry cv. Camarosa using pot experiment. Chlorophyll and malondialdehyde (MDA) contents, catalase (CAT), superoxide dismutase (SOD), ascorbate peroxidase (APX) activities and mineral nutrient concentrations were investigated in both roots and leaves of strawberry plant after exposure Cd. RESULTS: Cd content in both roots and leaves was increased with the application of increasing concentrations of Cd. We found higher Cd concentration in roots rather than in leaves. Chlorophyll a and b was decreased in leaves but MDA significantly increased under increased Cd concentration treatments in both roots and leaves. SOD and CAT activities was also increased with the increase Cd concentrations. K, Mn and Mg concentrations were found higher in leaves than roots under Cd stress. In general, increased Cd treatments increased K, Mg, Fe, Ca, Cu and Zn concentration in both roots and leaves. Excessive Cd treatments reduced chlorophyll contents, increased antioxidant enzyme activities and changes in plant nutrition concentrations in both roots and leaves. CONCLUSION: The results presented in this work suggested that Cd treatments have negative effect on chlorophyll content and nearly decreased 30% of plant growth in strawberry. Strawberry roots accumulated higher Cd than leaves. We found that MDA and antioxidant enzyme (CAT, SOD and APX) contents may have considered a good indicator in determining Cd tolerance in strawberry plant

    Serotyping, genetic characterization and antimicrobial susceptibility determination of Vibrio anguillarum strains isolated from farmed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in the eastern Black Sea

    No full text
    WOS: 000412202400012Antibiotic resistance profile, serotyping and identification of Vibrio anguillarum isolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) cultured in cages in the Eastern Black Sea Region of Turkey, were performed in the study. the biochemical, serological and molecular techniques were used in identification of V. anguillarum isolates. the sequenced isolates were confirmed to be similar to V. anguillarum which stored under different accession numbers in GenBank database. the rate of 97-99% similarity were found among the compared isolates. All isolates were identified to be serotype O1 by slide agglutination test results. the antibiotic susceptibility test results showed that V. anguillarum isolates were resistant 100% to sulphamethoxazole, 90.6% to ampicillin, 71.9% to erythromycin, 62.5% to oxytetracycline, 46.9% to streptomycin and 31.3% to trimethoprim-sulfamethoxazole, but susceptible to oxolinic acid, enrofloxacin and florphenicol

    Serotyping, genetic characterization and antimicrobial susceptibility determination of Vibrio anguillarum strains isolated from farmed rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in the eastern Black Sea

    No full text
    Bu çalışmada, Türkiye'nin Doğu Karadeniz Bölgesi'nde kafeslerde yetiştirilen gökkuşağı alabalık (Oncorhynchus mykiss)'larından izole edilen Vibrio anguillarum suşlarının identifikasyonu ve serotiplendirilmesi yapıldı ve antimikrobiyal direnç profilleri belirlendi. V. anguillarum suşlarının tanımlanmasında biyokimyasal, serolojik ve moleküler teknikler kullanıldı. Dizi analizine gönderilen şuşlar GenBank veri tabanında farklı kabul numarasıyla kayıtlı olan V. anguillarum ile karşılaştırıldı. Karşılaştırma yapılan suşlar arasında %97-99 oranında benzerlik olduğu tespit edildi. Lam aglütinasyon test sonuçlarına göre, tüm izolatların serotip O1 olduğu belirlendi. Antimikrobiyal duyarlılık test sonuçlarına göre, izolatların sulphamethoxazole (%100), ampicilline (%90,6), eritromisine (%71,9), oksitetrasiklin (%62,5), streptomisin'e (% 46,9) ve trimetoprim+sulfametoksazol (%31,3) dirençli olduğu, fakat oksolinik asit, enrofloksasin ve florfenikole duyarlı olduğu tespit edildiAntibiotic resistance profile, serotyping and identification of Vibrio anguillarum isolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) cultured in cages in the Eastern Black Sea Region of Turkey, were performed in the study. The biochemical, serological and molecular techniques were used in identification of V. anguillarum isolates. The sequenced isolates were confirmed to be similar to V. anguillarum which stored under different accession numbers in GenBank database. The rate of 97-99% similarity were found among the compared isolates. All isolates were identified to be serotype O1 by slide agglutination test results. The antibiotic susceptibility test results showed that V. anguillarum isolates were resistant 100% to sulphamethoxazole, 90.6% to ampicillin, 71.9% to erythromycin, 62.5% to oxytetracycline, 46.9% to streptomycin and 31.3% to trimethoprim-sulfamethoxazole, but susceptible to oxolinic acid, enrofloxacin and florphenico
    corecore